Gwyddion - Wizualizacja i analiza danych z mikroskopów bliskich oddziaływań (SPM)

Wpis z serii interesujących programów na systemy Linux. Tym razem dotyczyć on będzie aplikacji Gwyddion, która umożliwia wizualizację i analizę danych otrzymanych za pomocą mikroskopów bliskich oddziaływań (SPM - Scanning Probe Microscopy) takich jak mikroskop sił atomowych (AFM), czy mu podobnych. Zdaję sobie sprawę, że nie wszyscy mają dostęp do takich narzędzi, dlatego do artykułu dołączam plik z danymi na temat przebadanej próbki złota.

Czym jest Gwyddion?

Jak już wspomniałem Gwyddion jest open source-owym programem umożliwiającym analizę i wizualizację danych uzyskanych przy pomocy mikroskopów bliskich oddziaływań. Ciężko mi powiedzieć jak wypada na tle komercyjnych aplikacji, bo z takimi nie pracowałem. Mimo, że Gwyddion jest całkowicie darmowym programem, to uważam, że ma on całkiem pokaźne możliwości.

Co potrafi Gwyddion?

Oto lista niektórych z możliwości tego programu:

• Widok topografii w 3D
• Eksportowanie do plików graficznych
• Dobór palety kolorów
• Ustawienia wykresów (osie etc.)
• Mierzenie odległości między skazanymi punktami powierzchni próbki
• Automatyczne zorientowanie
• Pobieranie profilu próbki przez dowolny odcinek
• Statystyka wskazanego obszaru
• Wartość minimalna i maksymalna
• Wartość średnia
• Wymiar powierzchni
• Inklinacje
• Rozkłady statystyczne (wysokość, kąt nachylenia itp.)
• Statystyka kolumnowo-wierszowa
• Obliczenie chropowatości na wskazanym odcinku
• Wycinanie obszarów
• Filtry, maski, uśrednienia, korekcje obrazu

Gdzie znaleźć program Gwyddion?

Aplikacja ta znajduje się w repozytoriach więc wystarczy wydać polecenie: Zachęcam również do odwiedzenia oficjalnej strony projekt z której również można go pobrać, ale i na której znajduje się dokumentacja tego narzędzia - Gwyddion

Próbka złota

Dla tych, którzy nie mają dostępu do mikroskopów bliskich oddziaływań, a chcieliby się programem Gwyddion pobawić, dołączam do artykułu plik z zapisem badań moich oraz moich kolegów ze studiów nad próbką złota. Topografia jest dość zróżnicowana, więc jest na co popatrzeć.

Do pobrania: AFM - Próbka złota